11ème Rencontres R - Sciencesconf.org

9:00 - 10:00 (1h)

Accueil des participants et café (Forum)

L'accueil se fait au bâtiment Grands Amphithéâtres 1er étage (Forum)

10:00 - 12:00 (2h)

Tutoriel Introduction pratique à R : les fondamentaux pour organiser, analyser et visualiser

auditoire Gutenberg

Claire Della-Vedova

› Introduction pratique à R : les fondamentaux pour organiser, analyser et visualiser - Claire Della-Vedova, DellaData 10:00-12:00 (2h)

10:00 - 12:00 (2h)

Tutoriel Conception d'applications Shiny avec {golem}

salle Mirzakhani

Vincent Guyader + Colin Fay + Laurent Spanu

› Conception d'applications Shiny avec {golem} - Vincent Guyader, ThinkR 10:00-12:00 (2h)

10:00 - 12:00 (2h)

Tutoriel {data.table}

salle informatique Russel

Toby Dylan Hocking

› Tutoriel {data.table} - Toby Dylan Hocking, Département d'informatique, Université de Sherbrooke, Québec 10:00-12:00 (2h)

10:00 - 12:00 (2h)

Tutoriel {torch}, {tabnet} et l'apprentissage profond par l'usage

salle informatique Vaughan

Christophe Regouby

› {torch}, {tabnet} et l'apprentissage profond par l'usage - Christophe Regouby, Airbus 10:00-12:00 (2h)

12:00 - 13:30 (1h30)

Repas

Cafétaria/resto U

13:30 - 13:40 (10min)

Ouverture des Rencontres R 2025

auditoire Van Gogh

Philippe Grosjean

13:40 - 15:20 (1h40)

R et son écosystème

auditoire Van Gogh

Rémy Drouilhet

› R and CRAN on Ubuntu With r2u - Dirk Eddelbuettel, Department of Statistics, University of Illinois Urbana-Champaign 13:40-14:20 (40min)

› Air, un nouveau formateur de code pour R - Lionel Henry, Posit, PBC 14:20-14:40 (20min)

› Sharing data science artifacts across teams using Crane - Lucianos Lionakis, OpenAnalytics 14:40-15:00 (20min)

› Simplifiez, fiabilisez et accélérez vos workflows R complexes avec {targets} - Vincent Guyader, ThinkR 15:00-15:20 (20min)

15:20 - 15:50 (30min)

Pause café

Forum

15:50 - 16:50 (1h)

Visualisation et cartographie

auditoire Van Gogh

Maëlle Salmon

› Rajouter l'interactivité à vos ggplots avec animint2 - Toby HOCKING, Université de Sherbrooke 15:50-16:10 (20min)

› De la carte aux modèles spatiaux - Corentin Visée, Département de Géographie, UNamur, Institute of Life, Earth and Environment [Namur] 16:10-16:30 (20min)

› PhaochR : géocoder des adresses belges avec R - Hugo Périlleux, Universite Libre de Bruxelles - Joël Girès, Observatoire de la Santé et du Social de Bruxelles-Capitale 16:30-16:50 (20min)

15:50 - 16:50 (1h)

Interopérabilité

auditoire Gutenberg

› RProtoBuf: sérialiser pour communiquer - Tanguy BARTHELEMY, INSEE 15:50-16:10 (20min)

› Le format Parquet et l'écosystème DuckDB: l'essayer c'est l'adopter! - Lino Galiana, INSEE 16:10-16:30 (20min)

› Créer des applications RAG-LLM avancées avec R Shiny - Mohamed El Fodil Ihaddaden, HDI Global SE 16:30-16:50 (20min)

16:50 - 17:00 (10min)

17:00 - 17:35 (35min)

Présentations courtes 1

auditoire Van Gogh

Guyliann Engels

› Développement de workflows en R pour le nettoyage, la validation et la visualisation de données spatiales en écologie - Jordan Benrezkallah, Laboratoire de Zoologie [Mons], Laboratoire d'Écologie des Interactions et Changements globaux [Mons] 17:00-17:05 (05min)

› PATAPI : un outil de planification des pesées de bovins développé avec R - Maxime Legris, Institut de l'Elevage 17:05-17:10 (05min)

› Framework d'import de base de données en fichiers pour la recherche clinique : le package {EDCimport} - Dan Chaltiel, Bureau de Biostatistique et d'Épidémiologie, Team Oncostat 17:10-17:15 (05min)

› Transition SAS à R en recherche clinique : traduction et validation de macros SAS - Nusaibah Ibrahimi, Gustave Roussy, Bureau de Biostatistiques et d'Epidémiologie, Université Paris-Saclay, Villejuif, France, Inserm, Université Paris-Saclay, CESP U1018, Oncostat, labeled Ligue Contre le Cancer, Villejuif, France 17:15-17:20 (05min)

› {microinverterdata}, la collecte de données de votre souveraineté énergétique - Christophe Regouby, Airbus 17:20-17:25 (05min)

› Un exemple d'utilisation du package likert et l'interface R Shiny pour la visualisation et l'analyse de questionnaires d'auto-évaluation des pratiques de pédagogie inclusive à l'université - Viet Chau Linh Nguyen, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), équipe Eduwell 17:25-17:30 (05min)

› Approche morphométrique 3D par Analyse Procrustes Généralisée sous R - Nicolas Neels, Université de Mons / University of Mons 17:30-17:35 (05min)

17:35 - 17:45 (10min)

17:45 - 21:00 (3h15)

Posters + Q/R des présentations courtes 1 et cocktail dinatoire

Forum

› audio.whisper – Speech Recognition in R - Jan Wijffels, bnosac 17:50-20:00 (2h10)

› dbreportR : Un package R pour la documentation automatisée des bases de données - Sébastien Boutry, INRAE Nlle Aquitaine - Bordeaux / U.R. EABX - David Carayon, INRAE Nlle Aquitaine - Bordeaux / U.R. EABX 17:50-20:00 (2h10)

› Des Learning Analytics qui ne manquent pas d'R - Patrice ARMAND, Service d'appui pédagogique, Université de Mons - Philippe Grosjean, Service d'Écologie numérique, Instituts Infortech et Complexys, Université de Mons 17:50-20:00 (2h10)

› Détection et quantification de manipulations comptables autour d'un seuil psychologique avec R - Jerome Saracco, ASTRAL, Institut de Mathématiques de Bordeaux, Ecole Nationale Supérieure de Cognitique 17:50-20:00 (2h10)

› Faciliter la prise en compte des risques économiques en agriculture grâce à R et Shiny - Morgane Topart, Agro-Transfert Ressources et Territoires - Aïcha Ronceux, Agro-Transfert Ressources et Territoires 17:50-20:00 (2h10)

› iteR : Un package R pour l'analyse de matrices de confusions issues d'expériences de perception phonétique. - Olivier Crouzet, Laboratoire de Linguistique de Nantes (UMR6310) 17:50-20:00 (2h10)

› Pages d'aide simplifiées et en français dans R grâce à l'IA - Guyliann Engels, Service d'écologie numérique, Institut Complexys & Infortech, Université de Mons 17:50-20:00 (2h10)

› Rescuelog : Collecte numérique et reporting des interventions de sauveteurs à l'océan avec (ru)ODK, Shiny et SK8 - David Carayon, Ecosystèmes aquatiques et changements globaux 17:50-20:00 (2h10)

› rix: Reproductibilité d'Environnements De Développement R Avec Nix - Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche 17:50-20:00 (2h10)

› Workflow automatisé d'intégration et d'analyse de données en Shiny - Mélanie Demeure, IT&M STATS, CHANEL Parfums Beauté 17:50-20:00 (2h10)

	Lun. 19	Mar. 20	Mer. 21
09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00 18:00 19:00 20:00 21:00 22:00 23:00	Accueil des participants et café (Forum) 9:00 - 10:00 (1h) Accueil des participants et café (Forum) L'accueil se fait au bâtiment Grands Amphithéâtres 1er étage (Forum) Tutoriel Introduction pratique à R : les fondamentaux pour organiser, analyser et visualiser Tutoriel Conception d'applications Shiny avec {golem} Tutoriel {data.table} Tutoriel {torch}, {tabnet} et l'apprentissage profond par l'usage 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel Introduction pratique à R : les fondamentaux pour organiser, analyser et visualiser auditoire Gutenberg Claire Della-Vedova › Introduction pratique à R : les fondamentaux pour organiser, analyser et visualiser - Claire Della-Vedova, DellaData 10:00-12:00 (2h) 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel Conception d'applications Shiny avec {golem} salle Mirzakhani Vincent Guyader + Colin Fay + Laurent Spanu › Conception d'applications Shiny avec {golem} - Vincent Guyader, ThinkR 10:00-12:00 (2h) 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel {data.table} salle informatique Russel Toby Dylan Hocking › Tutoriel {data.table} - Toby Dylan Hocking, Département d'informatique, Université de Sherbrooke, Québec 10:00-12:00 (2h) 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel {torch}, {tabnet} et l'apprentissage profond par l'usage salle informatique Vaughan Christophe Regouby › {torch}, {tabnet} et l'apprentissage profond par l'usage - Christophe Regouby, Airbus 10:00-12:00 (2h) Repas 12:00 - 13:30 (1h30) Repas Cafétaria/resto U Ouverture des Rencontres R 2025 13:30 - 13:40 (10min) Ouverture des Rencontres R 2025 auditoire Van Gogh Philippe Grosjean R et son écosystème 13:40 - 15:20 (1h40) R et son écosystème auditoire Van Gogh Rémy Drouilhet › R and CRAN on Ubuntu With r2u - Dirk Eddelbuettel, Department of Statistics, University of Illinois Urbana-Champaign 13:40-14:20 (40min) › Air, un nouveau formateur de code pour R - Lionel Henry, Posit, PBC 14:20-14:40 (20min) › Sharing data science artifacts across teams using Crane - Lucianos Lionakis, OpenAnalytics 14:40-15:00 (20min) › Simplifiez, fiabilisez et accélérez vos workflows R complexes avec {targets} - Vincent Guyader, ThinkR 15:00-15:20 (20min) Pause café 15:20 - 15:50 (30min) Pause café Forum Visualisation et cartographie Interopérabilité 15:50 - 16:50 (1h) Visualisation et cartographie auditoire Van Gogh Maëlle Salmon › Rajouter l'interactivité à vos ggplots avec animint2 - Toby HOCKING, Université de Sherbrooke 15:50-16:10 (20min) › De la carte aux modèles spatiaux - Corentin Visée, Département de Géographie, UNamur, Institute of Life, Earth and Environment [Namur] 16:10-16:30 (20min) › PhaochR : géocoder des adresses belges avec R - Hugo Périlleux, Universite Libre de Bruxelles - Joël Girès, Observatoire de la Santé et du Social de Bruxelles-Capitale 16:30-16:50 (20min) 15:50 - 16:50 (1h) Interopérabilité auditoire Gutenberg › RProtoBuf: sérialiser pour communiquer - Tanguy BARTHELEMY, INSEE 15:50-16:10 (20min) › Le format Parquet et l'écosystème DuckDB: l'essayer c'est l'adopter! - Lino Galiana, INSEE 16:10-16:30 (20min) › Créer des applications RAG-LLM avancées avec R Shiny - Mohamed El Fodil Ihaddaden, HDI Global SE 16:30-16:50 (20min) 16:50 - 17:00 (10min) Présentations courtes 1 17:00 - 17:35 (35min) Présentations courtes 1 auditoire Van Gogh Guyliann Engels › Développement de workflows en R pour le nettoyage, la validation et la visualisation de données spatiales en écologie - Jordan Benrezkallah, Laboratoire de Zoologie [Mons], Laboratoire d'Écologie des Interactions et Changements globaux [Mons] 17:00-17:05 (05min) › PATAPI : un outil de planification des pesées de bovins développé avec R - Maxime Legris, Institut de l'Elevage 17:05-17:10 (05min) › Framework d'import de base de données en fichiers pour la recherche clinique : le package {EDCimport} - Dan Chaltiel, Bureau de Biostatistique et d'Épidémiologie, Team Oncostat 17:10-17:15 (05min) › Transition SAS à R en recherche clinique : traduction et validation de macros SAS - Nusaibah Ibrahimi, Gustave Roussy, Bureau de Biostatistiques et d'Epidémiologie, Université Paris-Saclay, Villejuif, France, Inserm, Université Paris-Saclay, CESP U1018, Oncostat, labeled Ligue Contre le Cancer, Villejuif, France 17:15-17:20 (05min) › {microinverterdata}, la collecte de données de votre souveraineté énergétique - Christophe Regouby, Airbus 17:20-17:25 (05min) › Un exemple d'utilisation du package likert et l'interface R Shiny pour la visualisation et l'analyse de questionnaires d'auto-évaluation des pratiques de pédagogie inclusive à l'université - Viet Chau Linh Nguyen, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), équipe Eduwell 17:25-17:30 (05min) › Approche morphométrique 3D par Analyse Procrustes Généralisée sous R - Nicolas Neels, Université de Mons / University of Mons 17:30-17:35 (05min) 17:35 - 17:45 (10min) Posters + Q/R des présentations courtes 1 et cocktail dinatoire 17:45 - 21:00 (3h15) Posters + Q/R des présentations courtes 1 et cocktail dinatoire Forum › audio.whisper – Speech Recognition in R - Jan Wijffels, bnosac 17:50-20:00 (2h10) › dbreportR : Un package R pour la documentation automatisée des bases de données - Sébastien Boutry, INRAE Nlle Aquitaine - Bordeaux / U.R. EABX - David Carayon, INRAE Nlle Aquitaine - Bordeaux / U.R. EABX 17:50-20:00 (2h10) › Des Learning Analytics qui ne manquent pas d'R - Patrice ARMAND, Service d'appui pédagogique, Université de Mons - Philippe Grosjean, Service d'Écologie numérique, Instituts Infortech et Complexys, Université de Mons 17:50-20:00 (2h10) › Détection et quantification de manipulations comptables autour d'un seuil psychologique avec R - Jerome Saracco, ASTRAL, Institut de Mathématiques de Bordeaux, Ecole Nationale Supérieure de Cognitique 17:50-20:00 (2h10) › Faciliter la prise en compte des risques économiques en agriculture grâce à R et Shiny - Morgane Topart, Agro-Transfert Ressources et Territoires - Aïcha Ronceux, Agro-Transfert Ressources et Territoires 17:50-20:00 (2h10) › iteR : Un package R pour l'analyse de matrices de confusions issues d'expériences de perception phonétique. - Olivier Crouzet, Laboratoire de Linguistique de Nantes (UMR6310) 17:50-20:00 (2h10) › Pages d'aide simplifiées et en français dans R grâce à l'IA - Guyliann Engels, Service d'écologie numérique, Institut Complexys & Infortech, Université de Mons 17:50-20:00 (2h10) › Rescuelog : Collecte numérique et reporting des interventions de sauveteurs à l'océan avec (ru)ODK, Shiny et SK8 - David Carayon, Ecosystèmes aquatiques et changements globaux 17:50-20:00 (2h10) › rix: Reproductibilité d'Environnements De Développement R Avec Nix - Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche 17:50-20:00 (2h10) › Workflow automatisé d'intégration et d'analyse de données en Shiny - Mélanie Demeure, IT&M STATS, CHANEL Parfums Beauté 17:50-20:00 (2h10)	Applications de R et des statistiques en sciences humaines 9:00 - 10:40 (1h40) Applications de R et des statistiques en sciences humaines auditoire Van Gogh Kathy Huet › R pour l'analyse de données vectorielles en analyse de la parole - Olivier Crouzet, Laboratoire de Linguistique de Nantes, UFR Lettres et Langages 09:00-09:40 (40min) › Traiter des verbatims et questions ouvertes à l'aide d'un modèle d'IA local - Thomas Vroylandt, Kantiles - Victoire Chatain, Kantiles - Emmanuel Herbepin, Kantiles 09:40-10:00 (20min) › Strengthening confidence in LLM-generated responses with TrustMe: a package for evaluating semantic proximities between responses generated by the NaileR package - Remi Mahmoud, Institut Agro Rennes-Angers 10:00-10:20 (20min) › fonctionr : l'inférence statistique pour tou-te-s - Joël Girès, Observatoire de la Santé et du Social de Bruxelles-Capitale - François Ghesquière, Institut wallon de l'évaluation, de la prospective et de la statistique, Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] - centre de recherche METICES 10:20-10:40 (20min) Pause café 10:40 - 11:10 (30min) Pause café Forum Statistique Reporting 11:10 - 12:10 (1h) Statistique auditoire Van Gogh Marie-Ange Remiche › gaussratiovegind : un package pour analyser la distribution du ratio de deux distributions normales – Application aux images de fluorescence de chlorophylle - Pierre Santagostini, IRHS - Équipe ImHorPhen (Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage) 11:10-11:30 (20min) › PerRegMod : un nouveau package R pour le test et l'estimation des modèles de régression à coefficients périodiques - REGUI SLIMANE, Abdelmalek Essaadi University [Tétouan] = Université Abdelmalek Essaadi [Tétouan], Abdelmalek Essaadi University [Tétouan] = Université Abdelmalek Essaadi [Tétouan] 11:30-11:50 (20min) › Make a difference: fast and accurate numerical derivatives with 'pnd' - Andreï V. Kostyrka, Université du Luxembourg 11:50-12:10 (20min) 11:10 - 12:10 (1h) Reporting auditoire Gutenberg Dan Chaltiel › Basculer d'une application shiny (SaaS) vers des rapports Rmarkdown en Pharmacovigilance (RaaS): résumé des avantages et inconvénients - Lionel Van Holle, OpenSourcePV 11:10-11:30 (20min) › Automatisations du contrôle qualité de formulaire de recueil de données et de rapport de résultats avec les packages docxtractr, flextable et officer - Nelly Le Guen, Haute Autorité de Santé [Saint-Denis La Plaine] 11:30-11:50 (20min) › Automatiser l'analyse de graphes d'hyperliens avec igraph - Robert Viseur, Université de Mons 11:50-12:10 (20min) Repas 12:10 - 13:30 (1h20) Repas Cafétaria/resto U Applications de R et des statistiques en écologie et sciences de l’environnement 13:30 - 14:50 (1h20) Applications de R et des statistiques en écologie et sciences de l’environnement auditoire Van Gogh Philippe Grosjean › R et le déclin des pollinisateurs : des outils statistiques au service de l'écologie - Maryse Vanderplanck, Centre d'Écologie Fonctionnelle & Évolutive 13:30-14:10 (40min) › Traiter les données collectées à l'aide de formulaires pour partager des inventaires et des résultats d'enquêtes. Développement informatique et application aux pratiques agroécologiques en Europe - Frédéric Vanwindekens, Centre wallon de Recherches agronomiques 14:10-14:30 (20min) › R au service du séquençage microbien : analyse et visualisation des résultats - Alice Delacuvellerie, Département de Protéomique et Microbiologie, Université de Mons, 20 place du Parc, 7000 Mons, Belgique 14:30-14:50 (20min) 14:50 - 15:00 (10min) Présentations courtes 2 15:00 - 15:35 (35min) Présentations courtes 2 auditoire Van Gogh Bruno Rodrigues › Utiliser les GitHub Actions pour automatiser des tâches : exemple de l'update de la version dev d'un package - Dan Chaltiel, Bureau de Biostatistique et d'Épidémiologie, Team Oncostat 15:00-15:05 (05min) › shiny2docker : dockeriser une application Shiny en toute simplicité - Vincent Guyader, ThinkR 15:05-15:10 (05min) › pkgdocs: a modular R package site generator - Daan Seynaeve, Open Analytics NV 15:10-15:15 (05min) › Nettoyer son code en un clin d'oeil avec flint - Etienne Bacher, sans affiliation 15:15-15:20 (05min) › Création d'un package d'échantillonnage de polytope en modélisation linéaire inverse - Jacques Brehelin, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme 15:20-15:25 (05min) › Outils et conseils pour la maintenance partagée de package R - Hugo Gruson, data.org 15:25-15:30 (05min) › La traduction du mlverse en français - Christophe Regouby, Airbus 15:30-15:35 (05min) Pause café + Q/R présentations courtes 2 15:35 - 16:10 (35min) Pause café + Q/R présentations courtes 2 Forum Quarto 16:10 - 17:10 (1h) Quarto auditoire Van Gogh Sophie Fagniart › Personnalisation de documents Quarto avec `_brand.yml` - christophe dervieux, Posit 16:10-16:30 (20min) › Dynamisez vos documents Quarto grâce à Observable JS - Antoine Bichat, Spotlight Medical 16:30-16:50 (20min) › Comment traduire vos documents efficacement dans R - Maëlle Salmon, rOpenSci 16:50-17:10 (20min) 17:10 - 17:20 (10min) Shiny Outils 17:20 - 18:20 (1h) Shiny auditoire Van Gogh Julie Aubert › ShinyProxy: easily deploy your Shiny apps - Tobia De Koninck, Open Analytics NV 17:20-17:40 (20min) › Tester une application Shiny : méthodologie et outils pratiques - Arthur Bréant, ThinkR 17:40-18:00 (20min) › Truffles : une application Shiny pour cultiver ses données... et ses truffes ! - Murielle Delmotte, ThinkR 18:00-18:20 (20min) 17:20 - 18:20 (1h) Outils auditoire Gutenberg Aurélie Siberchicot › RDepot - 100% open source enterprise management of R and Python repositories - Van Malder Jonas, OpenAnalytics 17:20-17:40 (20min) › DoReMIFaSol, un package pour simplifier l'usage des données en open-data de l'Insee - Pierre Lamarche, Centre de Recherche en Économie et Statistique, Institut national de la statistique et des études économiques (INSEE) 17:40-18:00 (20min) › Explorer le CRAN avec le package RWsearch - Patrice Kiener, InModelia 18:00-18:20 (20min) Dîner de Gala (Hotel Van der Valk) 19:00 - 23:55 (4h55) Dîner de Gala (Hotel Van der Valk)	Applications de R en médecine, pharmacie et biotechnologies 9:00 - 10:20 (1h20) Applications de R en médecine, pharmacie et biotechnologies auditoire Van Gogh Antoine Bichat › R, un catalyseur d'interdisciplinarité : tour d'horizon du projet eGait sur l'analyse de la marche - Aymeric Stamm, Laboratoire de Mathématiques Jean Leray 09:00-09:40 (40min) › Calcul d'indicateurs qualité à la Haute Autorité de Santé : Mise en place d'une migration de SAS vers R sans arrêt de la production des indicateurs - Anaëlle Coquelin, Haute Autorité de Santé [Saint-Denis La Plaine] 09:40-10:00 (20min) › OLAF, la reine des Apps Shiny ! - SOPHIE COURTADE-GAÏANI, Institut de Recherches Servier 10:00-10:20 (20min) Pause café 10:20 - 10:50 (30min) Pause café Forum Pédagogie et apprentissage de R 10:50 - 12:10 (1h20) Pédagogie et apprentissage de R auditoire Van Gogh François Husson › Apprendre R avec méthode et efficacité - Claire Della-Vedova, DellaData 10:50-11:30 (40min) › Rlinguo - R en natif sur mobile - Colin FAY, ThinkR 11:30-11:50 (20min) › R vous ment! - Antoine Fabri, cynkra 11:50-12:10 (20min) Discours de clôture des Rencontres R 2025 12:10 - 12:20 (10min) Discours de clôture des Rencontres R 2025 auditoire Van Gogh Philippe Grosjean Repas 12:20 - 14:00 (1h40) Repas Cafétaria/resto U